비정상 출혈이 있는 경우는 먼저 부인과 진찰, 초음파 검사, 혈액 검사 등을 통하여 기질적 원인이 있는지 확인해야 하며, 기질적 원인이 있을 경우에는 그 원인에 따른 치료가 필요합니다. 자궁 경부염, 용종, 경부 이형성증 및 종양이 비정상 출혈의 원인이 될 수 있으므로 자궁경부 세포진 검사(PAP SMEAR)가 필요하며 더불어 자궁경부 내의 병변이 있으면 생검을 시행합니다. 특히 35세 이상의 여성, 비만 여성 그리고 만성 무배란증의 기왕력이 있는 여성에서는 비정상 출혈이 있으면 자궁내막검사를 시행하기도 합니다.

기질적 병변 없이 신경-내분비계의 기능장애에 의해 발생하는 기능성 자궁출혈은 대부분 외과적 치료 없이 피임의 등을 이용한 호르몬 요법으로 치료할 수 있습니다. 출혈교정 외에 주기 조절의 효과도 기대할 수 있습니다. 드물게 호르몬 치료에 실패한 경우는 수술적 치료로 자궁내막을 제거하기도 합니다. 기질적 질환이 있는 경우는 그 원인 질환을 치료해야 합니다. 예를 들어 자궁 근종이나 폴립이 원인이 된다면 수술적 교정이 이루어져야만 출혈이 멎는 경우도 있습니다. 안드로젠 과다와 연관된 출혈은 정확한 진단과 함께 금기증이 없다면 경구피임제의 사용과 더불어 식이요법과 운동을 병행하는 것이 좋습니다.따라서 비정상 자궁 출혈의 원인을 정확히 알고 그에 맞는 적절한 처치를 해야 합니다.